ライブラリのアセンブリは当社のde novo遺伝子合成の専門知識と、高度な半導体技術によって行われています。
部位飽和変異
飽和スキャニング変異
コンビナトリアル変異
連続して位置する、あるいはタンパク質配列の全体に渡って散在する配列内で、一度に一つずつ、複数の部位を変異させます。
配列の規定の領域またはタンパク質配列全体中の、アミノ酸の連続するストリングをターゲットとします。
タンパク質の特定のターゲット領域に渡って、複数の部位を同時に変異します。
各バーは変異部位を、各色は特定のアミノ酸のバリアントの頻度を表す。
縮重(NNK)コドンまたは当社の正確なオリゴを使用して、4つの連続したアミノ酸部位のコンビナトリアル変異ライブラリを作製した。各部位で特定のアミノ酸が要求された。
ライブラリ構築に当社の半導体ベースオリゴを使用すると:
ライブラリのアセンブリは当社のde novo遺伝子合成の専門知識と、高度な半導体技術によって行われています。
変異体ライブラリは、バリアントのミックスされたプール(飽和スキャニングまたはコンビナトリアル変異ライブラリ)あるいは個別のサブプール(部位飽和変異ライブラリ)で納品され、各プールには単一のアミノ酸部位の全ての潜在的なバリアントを含んでいます。
当社はライブラリのカバレッジまたは多様性をテストするため、次世代シークエンシング(NGS)とサンガーシークエンシングの両方を提供しています。
Feature Article in Nature: How to make random mutagenesis less random
Engineered antibodies: semi-rational design approach for faster optimization
(Webinar) Rapid assembly of gene variant libraries to engineer proteins for user defined goals
(Webinar) Precision Mutant Library Helps In Protein Engineering New
しっかりと構築された変異ライブラリは、様々なタンパク質工学プロジェクトで大変有用なツールとなります。例えば:
Rice University
私はターゲティングと形質導入レベルの向上のために、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターの変異キャプシドを作りたいと思っていました。GenScriptは、ウイルスパッケージングの前後に、全ての希望バリアントに100%のカバレッジを持つコンビナトリアル変異体ライブラリを作製することができた上、アミノ酸がその部位にあって欲しくない部位に含まれるバリアントを除いてくれました。私がテストしたいバリアントのみのライブラリが提供されたことで、私のスクリーニングの労力を軽減し、最適なベクター配列を見つけるための時間を最大限にしてくれました。