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高品質な抗体とは、目的とする実験アッセイに最適な感度と特異性を持つものです。アプリケーションごとに性能仕様が異なるため、すべての抗体が幅広いアプリケーションで機能するわけではありません。例えば、ウェスタンブロットに使用される抗体は変性した直鎖状のタンパク質抗原を認識しますが、フローサイトメトリー、サンドイッチ ELISA、IF、および機能性アッセイ等では、すべてタンパク質の自然な折り畳み形状を認識する抗体が必要となります。

研究ニーズに最適なカスタム抗体の開発を始める際に、以下の事項を予めご確認ください。

• カスタム抗体の使用目的
• ポリクローナル抗体とモノクローナル抗体のどちらがアッセイに適しているか
• Protein/epitope of interestの局在箇所
• エピトープは抗原特異的か、線状か立体構造を取っているか、表面に露出しているか、翻訳後修飾を受けているか

このような事項を明確にしておくことで、当社は抗原に最適な条件で抗体作製プロセスを開始することができ、最終的には目的とする抗体作製の成功率を最大化することができます。

ポリクローナル抗体とモノクローナル抗体にはそれぞれ長所と短所があり、研究用途によって使い分けることができます。

ポリクローナル抗体

ポリクローナル抗体（pAbs）は、抗体の混合集団で構成されているため、1つの抗原上の複数のエピトープを認識することができます。

アドバンテージ:

• ポリクローナル抗体が複数のエピトープに結合するため、標的タンパク質の検出時のシグナルを増加させることが可能
• 多型、グリコシル化の不均一性、わずかな変性など、抗原の変化をある程度許容する
• 抗原の性質が不明な場合に有用
• 抗原の複数のエピトープを認識するため、検出のロバスト性が高い
• 一般的には、モノクローナル抗体と比較してより安定であり、安価かつ迅速な生産が可能

ディスアドバンテージ:

• バッチ間差が生じやすい
• 複数のエピトープを認識するため、交差反応を起こしやすい

モノクローナル抗体

ポリクローナル抗体と比較すると、モノクローナル抗体は単一の抗体クローンに由来し抗原上の単一のエピトープを認識するため、特異性が高くなります。

アドバンテージ:

• ハイブリドーマセルラインにより、均質で特異性の高いmAbを継続的に生産可能
• 実験条件が一定に保たれる場合、mAbを用いた実験の高い再現性を維持する事が可能
• mAbは一つのエピトープだけに特異的であり、バッチ間差が生じにくいため、治療薬や診断薬など、製造手順の標準化が必要な場合に有用
• 高い特異性に加え、バックグラウンドノイズや交差反応性が低い為、実験(western blot/IP, affinity purification, ELISA, mass spectrometry, 等)における高い効率および再現性を得る事が可能
• アプリケーションに必要な抗体の特性（感度要件、交差反応性、等）を指定し、必要な要件を満たすモノクローナル抗体をスクリーニングする事が可能

ディスアドバンテージ:

• その高い特異性により、例えば種を超えた交差反応等が得られにくい可能性がある
• ポリクローナル抗体と比較して、抗原の変性等によるエピトープの損失に対してより脆弱である。2種類以上のモノクローナル抗体プールを用いるなどが解決策として挙げられる
• pAbと比較すると、mAbはより高価かつ作製に時間を要する

抗原は大きく分けて7種類に分類できます。

• 合成ペプチド(20aa未満)
• 組換えタンパク質フラグメントまたは全長タンパク質
• 資源から直接精製されたネイティブタンパク質
• 細胞
• DNA
• 低分子化合物
• 抗体 (Anti-idiotype抗体作製用)

これらのカテゴリーにはそれぞれ長所と短所があり、どのタイプの抗原が目的の抗体作製プロジェクトに最も適しているのかを見極めることが重要です。