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Figure from: Cryo-EM image of
BetaCoV2019-2020.Courtesy:
IVDC, China CDC

2020年1月21日、米国疾病対策センター（CDC）は、先月中国・武漢で発生した新型コロナウイルスの米国初の感染例を報告した。米国への新型コロナウイルスの到着は、タイ、日本、韓国、台湾で報告された感染例に続いて、世界的な拡散における懸念を更に高めます。専門家らによって、新型コロナウイルスは、人と人との間で感染することが確認されており、ウイルスをコントロールすることは非常に困難な可能性があることを示しています。

培養されたウイルスや複数の肺炎患者から採取したサンプルを、次世代シークエンシング（NGS）により解析した結果、武漢の肺炎患者の原因となった病原体は、 新型のbetacoronavirus（SARS-CoVやMERS-CoVと同系統）であることが確認されました。電子顕微鏡検査の結果，このウイルスは特徴的なクラウン形態を持つコロナウイルスであることも明らかになりました。

このbetacoronavirusのゲノム配列は、特異的な診断テストの開発、および介入の必要性を特定するために非常に重要です。このウイルスの完全なゲノム配列データは、NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947 )で公開されており、入手可能です。現在、配列情報を利用して、新型コロナウイルスを検出するための遺伝子増幅（PCR）アッセイ法が開発されており、また、リアルタイムPCR（qPCR）アッセイを用いた診断キットが市販され、急速に普及してきています。確定症例数の急増の背景には、検出法がタイムリーに出現したという事もまた一因と考えられます。