弊社は、人工遺伝子合成サービスにおいて業界をリードする企業として、遺伝子発現系に革新をもたらす継続的開発研究に専念し最新技術を取り込んできました。OptimumGene 遺伝子デザインシステムは、Particle Swarm Optimization(PSO)技術による独自の遺伝子発現最適化技術で、既存の遺伝子を変えることにより発現系の遺伝子発現レベルを最大化することが可能です。
タンパク質産生量を増加させるコドン最適化
現在進めている研究にコドン最適化を活用するための参考にご利用ください。
通常、遺伝子発現の最適化はコドン表だけに依存しています。しかし、OptimumGene PSOアルゴリズムでは、コドンの適応性、mRNA構造、転写/翻訳を調節するシスエレメントなど、タンパク質産生の各段階で重要な様々な要素を検討します。このためOptimumGeneプラットフォームでは、どのような宿主細胞でもタンパク質産生を最大化する理想的な遺伝子シークエンスが得られます。
ワクチン遺伝子の発現や免疫原性の調節などに有用なソリューションを提供します。
極めて困難なプロジェクトの特殊なニーズに対しても、テーラーメードによる最適化が可能です。
弊社で独自に構築した豊富な種類のコドン表を用い、基礎研究や産業応用に使用される様々な宿主細胞に対応するコドンの最適化が可能です。コドン表には、例えば開発段階で一般的に使用されるPichia(ピキア酵母)やSf9昆虫細胞など、多くの生物種特異的なものがあります。
弊社にはコドン最適化および遺伝子合成において長年の経験と実績があり、OptimumGene により、主要な発現系で50,000を超える遺伝子のシークエンスを最適化してきました。多くの製薬大手企業において弊社のサービスをご利用頂いています。
図1.主要な発現系で50,000を超える遺伝子のシークエンスを最適化
Duke University
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"I think GenScript provides absolutely excellent products in a timely fashion. I have primarily used genscript to order codon optimized artificial genes. Ordering artificial genes on their website or via Email makes this especially facile because I can simply inquire about a gene, get a quote and then get a PO#. The whole process is fast and the turnaround time for obtaining the finished product is usually less than a month. I also think their technical support are wonderful people, they have been most helpful in facilitating the process. I am so impressed with them that I have recommended them to several of my colleagues."
OptimumGeneアルゴリズムはタンパク質の翻訳、転写、折りたたみに重要な様々なパラメータを最適化:
GC含量
CpGジヌクレオチド含量
隠れたスプライシング部位
ネガティブCpGアイランド
SDシークエンス
TATAボックス
転写終結シグナル
コドン使用頻度バイアス
GC含量
mRNA二次構造
PrematureポリAサイト
RNA不安定化モチーフ(ARE)
mRNAの安定したフリーエネルギー
Internal Chi sitesとリボソーム結合部位
コドン使用頻度バイアス
コドンとアンチコドンとの相互作用(コドン対形成)
コドンコンテクスト
RNA二次構造
OptimumGeneでは1回の処理で10,000種類のシークエンス最適候補が得られ、複雑な分類マトリックスにより各々の条件に最適なシークエンスが選択されます。
弊社は、お客様から得た遺伝子シークエンス情報や物質などを用いて実施したOptimumGeneによるコドン最適化やgene synthesis servicesにおいて、得られた成果や技術に関する知的財産について、その権利を主張することはありません。また、その情報を第3者に開示することもありません。秘密情報については、プロジェクトの運営上必要と判断された場合に限り、担当責任者に対してのみ共有されます。必要に応じて、遺伝子の最適化や合成に関する全ての知的財産権がお客様に帰属することを確認するために、秘密保持契約を締結します。